年假不休逾期作廢的做法合法嗎

不合法。
《企業職工帶薪年休假實施辦法》第十條規定：用人單位安排職工休年休假，但是職工因本人原因且書面提出不休年休假的，用人單位可以只支付其正常工作期間的工資收入。”即只有在勞動者以積極的明示的方式表示其不休年休假的情況下，才能判定勞動者做出了放棄年休假權利的意思表示。
而“年休假逾期申請視作自動作廢”的規定，實質是將勞動者消極的默示的行為作為其放棄年休假權利的意思表示，顯然與相關的規定不符。