政府工程墊資是合法的嗎

不合法。所謂“墊資施工承包”，是指建設方（地方政府）不用預付和按工程進度給付施工承包商工程款，而是作為施工承包商的建築企業預先墊付工程款，建設完成後再進行償付。《政府投資條例》正式開始施行，其中規定政府投資項目不得由施工單位墊資建設，違者追究刑事責任。
法律依據：《政府投資條例》第二十二條政府投資項目所需資金應當按照國家有關規定確保落實到位。政府投資項目不得由施工單位墊資建設。