專利合同糾紛如何處理

1.協商。未經專利權人許可，實施其專利，即侵犯其專利權，引起糾紛的，由當事人協商解決。
2.訴訟。專利糾紛當事人不願協商或者協商不成的，專利權人或者利害關係人可以向人民法院起訴。
3.專利管理部門調處。專利糾紛當事人也可以請求管理專利工作的部門處理。
法律依據：
《專利法》第六十條
未經專利權人許可，實施其專利，即侵犯其專利權，引起糾紛的，由當事人協商解決；不願協商或者協商不成的，專利權人或者利害關係人可以向人民法院起訴，也可以請求管理專利工作的部門處理。