自訴案件能否申請非法證據排除

不管公訴案件還是自訴案件，都可以適用非法證據排除的相關規定；如果你説的情況下，證人證言間存在實質性衝突，且偵查機關無法補正或者説明，那麼該證言相應的部分應予排除。在民事訴訟活動中，證人若非民事訴訟法第七十三條規定的經人民法院許可的特殊情形，證人不到庭，證言不能作為證據採納。刑事訴訟活動中，證人不到庭，其證言經過公訴人、被害人和被告人、辯護人質證並經查實可以作為定案依據。

《民事訴訟法》

第七十三條

經人民法院通知，證人應當出庭作證。有下列情形之一的，經人民法院許可，可以通過書面證言、視聽傳輸技術或者視聽資料等方式作證：（一）因健康原因不能出庭的；（二）因路途遙遠，交通不便不能出庭的；（三）因自然災害等不可抗力不能出庭的；（四）其他有正當理由不能出庭的。刑事訴訟法第五十九條 證人證言必須在法庭上經過公訴人、被害人和被告人、辯護人雙方質證並且查實以後，才能作為定案的根據。法庭查明證人有意作偽證或者隱匿罪證的時候，應當依法處理。