是否可以直接入股已經成立的分公司

不可以。分公司不具有法人資格，不是適格的民事權利主體。其沒有法人財產權，不是持有股權的適格主體。
分公司是指一個公司管轄的分支機構，即公司在其住所以外設立的以自己的名義從事活動的機構，按照《公司法》的規定，有限責任公司或股份有限公司設立的分公司不具有企業法人資格，其民事責任由總公司承擔，因此，分公司既然只是總公司的附屬機構，其股權自然由總公司進行分配，而不能自行分配股權。