原告代理人能不能提出判後答疑申請書

可以的。
有的高院申請再審，是一定要判後答疑的，否則立不了案。
下面是模板：
__區人民法院：
根據__人民法院___規定，現申請人___現就____一案，不認可貴院___判決結果，特提出如下答疑申請
第一關於___疑問。

第二關於___疑問。

第三關於___疑問。

第四關於___疑問。
綜述：___
此致
__區人民法院
申請人：
年月日
《刑事訴訟法》第一百八十七條