畜牧業強拆應該諮詢哪個部門

畜牧業強拆應該諮詢國土局或者規劃局。一般認為在農用地上建養殖場的無證建築並不一定是違法建築，也不應該按照違法建築強制拆除不予補償。
《城市房屋拆遷管理條例》第三十三條：因拆遷非住宅房屋造成停產、停業的，拆遷人應當給予適當補償。