私自轉讓土地建房法院會判決協議無效嗎

會判決無效的。農民集體所有的土地的使用權不得出讓、轉讓或者出租用於非農建設。原、被告私下達成的農用地轉讓協議，違反了國家法律的強制性規定，雙方簽訂的土地轉讓協議無效。合同被確認為無效後，當事人因該無效行為取得的財產應予以返還，雙方私自轉讓的土地仍歸被告所有。原告在協議簽訂後，即組織人員對該地塊進行了開發，造成該土地一定程度的破壞，應當進行恢復、平整。
《土地管理法》
第六十三條農民集體所有的土地的使用權不得出讓、轉讓或者出租用於非農業建設；但是，符合土地利用總體規劃並依法取得建設用地的企業，因破產、兼併等情形致使土地使用權依法發生轉移的除外。