工程合同糾紛怎麼去處理

1、當事人自願協商解決；
2、第三人或者人民調解委員會居中調解；
3、向仲裁委員會申請仲裁；
4、向人民法院提起民事訴訟。
5、法律依據：
《民法典》第一百八十八條規定，向人民法院請求保護民事權利的訴訟時效期間為三年。法律另有規定的，依照其規定。訴訟時效期間自權利人知道或者應當知道權利受到損害以及義務人之日起計算。法律另有規定的，依照其規定。但是，自權利受到損害之日起超過二十年的，人民法院不予保護，有特殊情況的，人民法院可以根據權利人的申請決定延長。