分公司入股協議有效嗎

看情況來判定：
其一、如果該協議是當事人真實的意思表示，並且內容不違反法律法規和社會公序良俗的，則該協議有效；
其二、如果不符合上述情況的，則該協議無效。
《民法典》第一百四十八條 一方以欺詐手段，使對方在違背真實意思的情況下實施的民事法律行爲，受欺詐方有權請求人民法院或者仲裁機構予以撤銷。