分居兩年了，男方不同意離婚，我該怎麼辦

事實上不管分居多久也不論分居的原因是什麼，有效婚姻都不會因此而自動解除。在分居滿兩年而男方又不願意離婚的情況下，可以向人民法院提起離婚訴訟。一般情況下，因感情不和分居滿兩年的，法院應先進行調解；調解不成的，將作出離婚判決。 
《中華人民共和國民法典》第一千零七十六條【協議離婚】夫妻雙方自願離婚的，應當簽訂書面離婚協議，並親自到婚姻登記機關申請離婚登記。
離婚協議應當載明雙方自願離婚的意思表示和對子女撫養、財產以及債務處理等事項協商一致的意見。