只有複印件的合同有效嗎

有效，只要是雙方真實意思表示且不違反法律規定。但是如果從法律風險上説，仍建議保留書面原件，以防發生合同糾紛的時候難以證明雙方當時的合意，從而不能保障當事人的權益。
《民法典》第四百九十一條：當事人採用信件、數據電文等形式訂立合同要求籤訂確認書的，簽訂確認書時合同成立。當事人一方通過互聯網等信息網絡發佈的商品或者服務信息符合要約條件的，對方選擇該商品或者服務並提交訂單成功時合同成立，但是當事人另有約定的除外。