土地確權時才知道土地被侵佔了怎麼辦呢

土地被侵佔可以向當地的國土局投訴反映情況。非法佔有土地的，由縣級以上人民政府土地行政主管部門責令限期改正或者治理，可以並處罰款；構成犯罪的，依法追究刑事責任。
【法律依據】
《刑法》第342條，違反土地管理法規，非法佔用耕地、林地等農用地，改變被佔用土地用途，數量較大，造成耕地、林地等農用地大量毀壞的，處五年以下有期徒刑或者拘役，並處或者單處罰金。