分居三年沒證據怎麼離

男女雙方可以就財產分割、子女撫養問題進行協議，協商不成的，到法院起訴申請解除婚姻關係。人民法院審理離婚案件，應當進行調解；如感情確已破裂，調解無效，應准予離婚。
《民法典》
第一千零七十六條 夫妻雙方自願離婚的，應當簽訂書面離婚協議，並親自到婚姻登記機關申請離婚登記。
離婚協議應當載明雙方自願離婚的意思表示和對子女撫養、財產以及債務處理等事項協商一致的意見。